Se define como Agrogenómica a la aplicación de la Genómica y de sus tecnologías en las áreas de agricultura, ganadería, acuacultura, silvicultura y otras afines, y que hace uso de los conocimientos y herramientas provenientes de otros campos como la Biología Celular, la Biología Molecular, la Genética, la Biotecnología y la Bioinformática.

Al ser un campo interdisciplinario, la Agrogenómica busca resolver la necesidad de producir alimentos para los seres humanos mediante la identificación, caracterización y aprovechamiento de los recursos genéticos potenciales, al mismo tiempo que busca su continuación mediante la protección y el fomento de los ecosistemas y de la biodiversidad asociada a ellos.

De manera puntual, la introducción de la secuenciación de nueva generación se convirtió en la esencia de los avances científicos en éste campo, siendo que en la actualidad las aplicaciones son múltiples y se han visto traducidas en el descubrimiento de rasgos genéticos de interés, en esquemas de sanidad e inocuidad alimentaria y en programas de mejoramiento genético.

A continuación, te presentamos las aplicaciones de la secuenciación NGS en la Agrogenómica:

• Caracterización y monitoreo de variantes genéticas

Genotipificación con microarreglos (genotyping arrays)

Genotipificación por secuenciación (genotyping by sequencing - GBS)

• Descubrimiento de rasgos complejos (asociación genotipo-fenotipo)

Estudios de asociación genética (Genome-Wide Association Studies)

• Programas de mejora genética

Selección asistida por marcadores (Marker-assisted selection)

Selección genómica (Genomic selection)

• Secuenciación de genomas completos (bacterias, hongos, virus / plantas, animales)

Genomas completos pequeños (small whole-genome sequencing)

Genomas completos grandes (large whole-genome sequencing; de novo assembly)

• Ecología y microbiología

Caracterización de estructura genética poblacional (population genomics)

Caracterización de microbiomas, viromas y resistomas (microbial genomics and metagenomics)

• Sanidad e Inocuidad

Monitoreo de enfermedades (Disease profiling and pathogen surveillance)

Inocuidad alimentaria (Food safety)

Si quieres ser parte de los impactos de la Agrogenómica, platícanos qué te gustaría lograr y te ayudamos a hacerlo realidad. Para más contenidos científicos, síguenos en redes sociales o suscríbete al Boletín mensual de #analiteklife.

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